Auf Veranlassung Friedrichs II., des Großen, wurde 1749 die Kolonie auf der „Grünen Aue" gegründet. 1754 erhielt sie den Status eines Dorfes mit dem Namen „Grüne Aue". Die vier aus der Pfalz stammenden reformierten protestantischen Kolonistenfamilien schlossen sich der lutherischen Kirche in Bohnsdorf und nicht der reformierten Gemeinde in Köpenick an. Mehr als 100 Jahre gingen die Grünauer sonntags nach Bohnsdorf zum Gottesdienst. Erst seit den achtziger Jahren des 19. Jh. fanden regelmäßige Gottesdienste in den jeweiligen Grünauer Schulgebäuden statt. 1891 entstand die selbständige Kirchen-Gemeinde Bohnsdorf - Grünau mit Sitz des Pfarrers in Grünau.

Im gleichen Jahr wurde der Bau einer eigenen Kirche in Grünau beschlossen. Aber erst am 20. Februar 1904 fand die Grundsteinlegung und am 14. Dezember 1906 das Fest der Kirchweihe statt. Der Name der Kirche wurde vom damaligen Pfarrer Carl Ludwig Hermann Rochow vorgeschlagen und von der Kaiserin Auguste Viktoria, unter deren Schirmherrschaft der Kirchbau stand, bestätigt.